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甲状腺乳头状癌的核外分子遗传和表观遗传学研究的开题报告

【摘要】

甲状腺乳头状癌是一种较为常见的甲状腺恶性肿瘤，而其核外分子遗传和表观遗传学特征目前还未完全阐明。本研究将通过基因组学和转录组学技术，综合研究甲状腺乳头状癌患者与正常对照组在基因表达、DNA甲基化水平以及组蛋白修饰等方面的差异，以期揭示其发生机制和临床治疗的候选靶点。

【关键词】甲状腺乳头状癌；核外分子；基因组学；转录组学；表观遗传学

【引言】

甲状腺乳头状癌（PTC）是一种主要起源于甲状腺滤泡上皮细胞的恶性肿瘤，而且在世界范围内都是最普遍的甲状腺疾病之一（1）。随着分子生物学和分子遗传学的发展，人们对于PTC的病因和分子机制的认识已经有了一定的突破。然而，对于PTC的核外分子遗传和表观遗传学特征的研究还比较缺乏。

目前，在核外分子遗传方面，与PTC相关的研究主要集中于miRNA、lncRNA等小分子RNA的调控功能，但其在多个实验中的表达水平和作用机制并不一致（2）。同时，PTC的表观遗传学也受到人们的重视，DNA甲基化和组蛋白修饰是两个关键的表观遗传标志，主要参与基因表达调控和染色质状态维持。近期研究发现，PTC中某些靶基因的DNA甲基化和/或组蛋白修饰水平与该肿瘤的淋巴结转移和临床预后相关（3）。因此，从核外分子遗传和表观遗传学方面系统性地研究PTC的特征，对于揭示其发生机制和潜在的治疗靶点具有重要的意义。

【研究问题】

PTC的核外分子遗传和表观遗传学特征是怎样的？其与该肿瘤的发生机制和临床特征有何关系？是否存在潜在的治疗靶点？

【研究目的】

通过基因组学和转录组学技术，系统性地研究PTC患者与正常对照组在核外分子遗传和表观遗传学方面的差异，?分析其与该肿瘤的关系和临床意义，为该肿瘤的预后和治疗提供新的方向。

【研究方法】

1.样本采集：收集PTC患者和正常对照组的甲状腺组织标本。

2.基因组学研究：?采用高通量测序技术（如RNA-seq）对患者和对照组的全基因组进行测序，以获得转录组数据。利用软件（如DESeq2）对两组数据进行差异分析，筛选出差异表达基因（DEGs），并进行GO、KEGG等富集分析。

3.转录组学研究：通过芯片技术，对两组样本进行基因表达分析，筛选出差异表达的基因。根据差异表达的miRNA和lncRNA，多重相关分析，共同预测和确认PTC潜在的自然靶标和调节网络。

4.表观遗传学研究：利用MeDIP-seq、ChIP-seq等技术，研究PTC患者和对照组在DNA甲基化和/或组蛋白修饰水平上的差异。对差异信号进行生物信息学分析，找出PTC的表观修饰微环境及其潜在调控机制。

【研究内容】

本研究将通过上述三个方面的研究，综合分析PTC患者与对照组在基因表达、DNA甲基化和组蛋白修饰等方面的差异，挖掘该肿瘤的特征和潜在的治疗靶点。其中，要重点关注PTC的个体差异性和预后因子与表观修饰信号的关系，探讨其预测性和诊断/治疗潜力。

【预期成果】

1.揭示PTC的核外分子遗传和表观遗传学特征，对该肿瘤的发生机制和潜在的治疗靶点进行挖掘。

2.确认PTC中与miRNA和lncRNA相关的靶标和调节网络，为基于此的治疗提供新想法。

3.发现PTC患者与正常对照组在DNA甲基化和组蛋白修饰水平上的差异，并分析其与预后和治疗效果的相关性，为该肿瘤的治疗和诊断提供新的方向和标志物。

【研究意义】

本研究能够深入探究PTC的核外分子遗传和表观遗传学特征，有助于我们更好地认识该肿瘤的发生机制和临床表现，为其治疗和预后提供新的靶点和标志物。