ChemOffice_2008_实用教程.pdf

ChemOffice2008实用教程 ——化学结构绘图 分子模拟 数据整合 主编：曾炜、孙延辉、李红霞 时间：2009年8月 目录 1. ChemOffice基础知识 2. ChemDraw操作基础 3. Chem3D操作基础 4. ChemFinder操作基础 1 1. ChemOffice基础知识 1.1 ChemOffice2008 简介 1.2 ChemOffice 2008 的模块 1.3 ChemOffice 2008 的安装与启动 1.4 其他绘图软件 2 1.1 ChemOffice2008简介 图1-1 ChemOffice发展历史 3 1.2 ChemOffice2008模块 ChemDraw：化学结构绘图（Chemical Structure Drawing Standard ） Chem3D：分子模拟分析绘图（Molecular Modeling and Analysis） ChemFinder：化学信息搜寻整合系统（Searching Information Integration） 4 1.2.1 ChemDraw模块组件 • AutoNom：是Beilsteiny最强的软件，现已包含于ChemDraw Ultra 中，它可按照IUPAC的标准自动命名化学结构。 • ChemNMR：预测13 1 C和 H-NMR谱图，节省实验费用。 • ChemProp：预测沸点（BP）、熔点（MP）、临界温度（Tc ）、 临界气压（CP ）、吉布斯自由能（G）、logP、折射率（n）、热 结构（HF）等性质。 • ChemSpec：提示用户输入JCAMP及SPC频谱数据，以比较 ChemNMR预测的结果。 • ClipArt：高质量的实验室玻璃仪器图库，用于搭配ChemDraw使用。 • NameStruct：输入IUPAC化学名称后可自动生成ChemDraw结 构。 5 1.2.2 Chem3D模块组件 •Excel Add-on：与微软的Excel完全整合，并可与ChemFinder联合使用。 •Gaussian Client：量子化学计算软件Gaussian 03W的客户端接口，可直接在 Chem3D中运行Gaussian，并提供数种坐标格式（需要安装Gaussian 03W ）。 Gaussian是做半经验计算和从头计算时使用最广泛的量子化学软件，可以研究分 子能量和结构、过渡态的能量和结构、化学键、反应能量、分子轨道、偶极矩和多 极矩、原子电荷和电势、振动频率、红外和拉曼光谱、NMR、极化率和超极化率、 热力学性质以及反应路径等。计算可以模拟在气相和溶液中的体系，模拟基态和激 发态。Gaussian 03还可以对周期边界体系进行计算。Gaussian是研究取代效应、 反应机理、势能面和激发态能量的有力工具（需另外获得GAMESS）