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叶锈菌侵染早期TcLr19 SSH文库构建及ESTs序列分析的开题报告
参照候选甲基化靶基因的特异性表达方法,可利用差异表达方法,构建侵染早期叶锈菌的TcLr19 SSH文库。通过对文库中的ESTs序列分析,可以深入研究叶锈菌对植物的侵染机制,探究其抗性机制。
本次开题报告主要分为以下几个部分:
一、研究背景和意义
叶锈病是一种普遍存在于植物中的病害,由叶锈菌引起。对叶锈菌对植物的侵染机制进行深入研究,可以为防治叶锈病提供理论依据和技术支撑。同时,探究植物的抗性机制,有助于提高植物的抗病性和农作物的产量。
二、研究方法和技术路线
1.构建叶锈菌侵染早期TcLr19 SSH文库;
2.对文库中的ESTs序列进行分析,包括从ESTs中预测可能的编码基因、寻找编码基因的同源物等。
三、预期研究结果
通过构建差异表达文库并对ESTs序列进行分析,可以获得相关的基因信息,进而深入研究叶锈菌对植物的侵染机制和植物的抗性机制。同时,可以预测植物的抗性基因和获得相关的分子标记,为育种提供重要的理论和实际依据。
四、时间计划
1.文献综述和实验技术训练:2个月;
2.样本采集、RNA提取和差异表达文库构建:3个月;
3.SSH文库筛选、ESTs测序和初步数据分析:3个月;
4.数据深入分析和结果验证:6个月。
五、拟解决的问题和难点
难点在于SSH文库构建和ESTs序列分析过程中可能产生的误差和假阳性。解决问题的关键在于选择合适的方法和技术,确保实验的可靠性和有效性。
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