高级别胶质瘤患者预后模型的构建及SLC4A2的促癌作用研究.pdf
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中文摘要I
AbstractIII
缩略词表V
第一章综述1
1.1脑胶质瘤的流行病学1
1.2高级别胶质瘤的分类及诊断2
1.2.1分类2
1.2.2诊断3
1.3高级别胶质瘤的治疗5
1.3.1手术治疗5
1.3.2放射治疗5
1.3.3化学治疗7
1.3.4分子靶向治疗7
1.3.5免疫疗法8
1.4高级别胶质瘤预后分子生物标志物的研究9
1.4.1mRNAs相关分子标志物9
1.4.2miRNAs相关分子标志物10
1.4.3lncRNAs相关分子标志物10
1.4.4免疫相关分子标志物11
1.4.5离子通道相关分子标志物11
1.5本论文的研究目的与意义12
第二章高级别胶质瘤关键基因预后模型的构建及验证13
前言13
2.1数据库和生物信息学软件13
2.1.1CGGA数据库13
2.1.2GEO数据库13
2.1.3R语言14
2.1.4RStudio14
2.2实验方法14
2.2.1高级别胶质瘤转录组数据的获取与处理14
2.2.2差异表达基因的筛选15
2.2.3GO和KEGG富集分析15
2.2.4Log-ranktest分析与单因素Cox回归分析16
2.2.5Lasso回归分析16
2.2.6Kaplan-Meier生存分析16
2.2.7多因素Cox分析17
2.2.8预后模型性能评估17
2.2.9风险因子三图联动和ROC曲线18
2.2.10整合基因表达和临床特征的预测模型18
2.3实验结果18
2.3.1高级别胶质瘤中差异表达的mRNAs18
2.3.2差异基因GO和KEGG富集分析19
2.3.3高级别胶质瘤患者预后相关关键基因的获取21
2.3.4预后模型的构建24
2.3.5预后模型的评估25
2.3.6预后模型的风险评分验证26
2.3.7预后关键基因和临床特征的预测模型27
2.4讨论28
第三章高级别胶质瘤预后关键基因在HGG患者复发、诊断中的价值31
前言31
3.1数据库和生物信息学软件31
3.2实验方法31
3.2.1数据下载与处理31
3.2.2预后预测特征的建立和验证32
3.2.3构建Logistic回归模型32
3.3实验结果33
3.3.1评估预后关键基因对HGG患者复发的预测作用33
3.3.2建立预测HGG患者复发概率的诺莫图并评价其预测效果34
3.3.3基于预后关键基因的HGG诊断模型的建立36
3.4讨论37
第四章关键基因SLC4A2在胶质母细胞瘤中的生物学功能探究39