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转录因子CTCF的克隆、表达纯化与功能分析的任务书
任务描述:
转录因子CTCF是一种广泛存在于哺乳动物中的核蛋白质,通过结合DNA序列调节基因表达和基因组拓扑结构等多种生物学过程。本任务旨在对CTCF进行克隆、表达纯化和功能分析,以更深入地研究该转录因子在基因调控和表观遗传学中的作用。
任务步骤:
1.克隆CTCF基因:利用已有CTCF基因序列设计引物并用PCR扩增得到CTCF基因,然后进行酶切和连接,构建克隆载体。
2.表达CTCF蛋白:将CTCF基因插入表达载体中,并转化至表达菌株中。利用蛋白质组学技术分析表达大量CTCF蛋白的最佳条件,优化表达条件,并纯化CTCF。
3.CTCF结合DNA鉴定:利用电泳迁移实验或其他合适的技术,分析纯化后的CTCF蛋白能否结合到特定DNA序列上。检测完成后,用荧光染料标记结合的蛋白质和DNA,并通过荧光显微镜观察。
4.CTCF在基因组拓扑结构中的作用:利用Hi-C等技术,测定细胞核中基因组拓扑结构的形成以及CTCF对拓扑结构的起调控作用。
5.分析CTCF对某些基因转录的影响:利用CRISPR-CAS9,通过敲除CTCF基因或CTCF结合位点分析CTCF对基因转录的影响。
6.其他CFTC相关功能:通过大量文献的综述,在研究CTCF蛋白的基础上,进一步阐述CTCF在其他生物学过程中的功能和生物学意义。
任务目标:
1.成功克隆CTCF基因并表达纯化蛋白。
2.确定CTCF与特定DNA序列的结合关系,进一步分析其在基因组拓扑结构中调控的作用。
3.通过CRISPR-CAS9分析CTCF对某些基因的转录调控作用。
4.成功阐释CTCF在多种生物学过程中的作用和生物学意义。