植物DNA条形码应用于大样地群落学研究-中国森林生物多样性监测.PDF

第七届海峡两岸森林动态样区研讨会 植物DNA条形码 应用于大样地群落学研究 裴男才，陈步峰，李健容 中国林科院热带林业研究所 国家林业局珠江三角洲森林生态系统定位研究站 10/22/2013，温州 1 提纲 • DNA条形码简介 • DNA条形码在大样地中的应用  保存生物资源  鉴别植物物种  构建群落系统发育关系  揭示群落系统发育结构  评估生物多样性指数 • 讨论 2 DNA条形码（Barcode ） • 主要理念：通过获取生物组织中一段短的 DNA序列，快速而准确地在物种水平上进 行分类和鉴定的技术 3 Hebert et al., 2003, 2004 条形码片段位置 rbcL, coding gene, low evolution rate matK, coding gene, fast evolution rate trnH-psbA , non-coding spacer region, fast evolution rate Slide from John Kress 叶绿体DNA 4 研究机构 • 国际生命条形码联盟（Consortium for the Barcode of Life ）是全球生物DNA条形码研 究的协调机构，在欧美、亚太等主要生物 多样性研究地区设有节点或分支，涵盖50 多个国家和地区的200多个组织和机构。 Consortium for the Barcode of Life, / 5 应用1：保存生物资源 The International Barcode of Life Project (iBOL): activated in October 2010. Its first phase (2010-2015): 5M specimens, 500K species. 截止到2013年6月30 日 Sequences: 117,184 Specimens: 116,552 6 应用2 ：鉴别植物物种 • 弥补分类学家之不足 • 常用搜索工具：BLASTn ；TaxonDNA 7 Altschul et al., 1997; Meier et al., 2006 CTFS network • Center for Tropical Forest Science (/) • ~ 48 Plots, 22 Countries, 4.5 Million Trees, 8500 Species 8