【单细胞测序系列11】单细胞转录组揭示不同性别的甲状腺乳头状癌的细胞分化和免疫微环境的差异.pdf

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【单细胞测序系列11】单细胞转录组揭示不同性别的甲状腺乳头状癌的细

胞分化和免疫微环境的差异

引用：Single‐celltranscriptomiclandscaperevealsthediferencesincelldiferentiationandimmune

microenvironmentofpapillarythyroidcarcinomabetweengenders.

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背景：甲状腺乳头状癌（PTC）是甲状腺癌（TC）的主要病理类型。性别是PTC患者的一个重要背景参数。在这里，

我们的目的是描述PTC中细胞簇和免疫微环境的差异与性别有关。

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一、三组样本在单细胞水平上的转录组分析

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a.实验的过程和原理。收集组织并分离组织，制备单细胞文库，然后测序并分析所有数据。

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b.tSNE图可视化显示三组细胞组分。三组中的被试用不同的颜色显示。

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c.三组中有代表性的细胞簇的频率见柱状图。

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d.推断cnv的后续数据分析策略，包括异性恶性细胞的基因定位和异性T和B细胞的分化。

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二、男性和女性患者中恶性上皮细胞的细胞簇和基因表达

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a.采用推断CNV算法分析男性和女性PTC患者及结节性甲状腺肿组上皮细胞的基因拷贝数变异。

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b.二维tSNE可视化显示三组患者的恶性和非恶性上皮细胞。患有恶性或非恶性细胞的受试者使用不同的颜色显示。

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